天界での記憶を取り戻したネプテューヌ。天界を救うため妹のネプギアとともに天界へ戻ろうとするが、天界の管理システムの再起動に必要なデータを収集しないで戻っても二度手間と知り、マジェコンヌ学長の指示のもとネプテューヌとネプギアは別チームでデータ収集を開始することに。しかし、暴走したシステムがネプギア達に容赦なく襲いかかる。
妹たち大活躍の「ネプテューヌ はいすくーる」第4弾!!